При операції на верхніх різцях, якщо виробляють не дугоподібний, А горизонтальний розріз між околоверхушечной областю та грушовидним отвором, то зважаючи тонкого кісткового шаруможе послідувати перфорація в порожнину носа. Краї рани, незважаючи на шви, можуть розійтися з утворенням носо-вестибулярного свища, пластика якого через наявність оточуючих рубців буває скрутній.
В процесі операції на верхніх малих корінних зубах (Іноді на іклі) може відбутися перфорація лицьової стінки пазухи, якщо пазуха має підвищену легкість. При розрізі м'яких тканин на висоті верхівки кореня горизонтально може статися розбіжність країв рани і утворитися свищ між гайморової порожниною і передоднем порожнини рота. В результаті може виникнути поліпозний гнійний синусит.
Під час операції нижніх малих корінних зубів тупим гачком може бути пошкоджений підборіддя нерв. На відповідній половині губи в залежності від ступеня травми можуть виникнути явища парестезії, гипестезии або анестезії. Дуже рідко зустрічається, але з прогностичної точки зору дуже несприятливий ускладнення - гострий періостит та остеомієліт. У цих випадках рану розкривають і при необхідності на короткий термін дренують. Ускладнення, які можуть з'явитися через кілька тижнів або місяців: освіта свища на яснах, чутливість оперованого зуба до натиснення (хронічний періодонтит), помірна набряклість м'яких тканин в оперованої області.
У цих випадках на контрольному рентгенівському знімку видно недостатнє пломбування кореня пломбувальних матеріалів (гутаперчей). При цьому не спостерігається ні найменшої ознаки репарації кісткової тканини в області верхівки кореня. Відсутність репарації спостерігається також і в тому випадку, якщо резецируется занадто велика частина кореня. У разі згаданих пізніх ускладнень міняють пломбу кореня і в околоверхушечной області виробляють ретельний кюретаж. У виняткових випадках, коли немає можливості ввести в кореневий канал гутаперчевую пломбу до кордону між середньою і верхівкової третини кореня і є умови для збереження зуба (штіфтовий зуб), то пломбування кореня роблять у процесі операції ретроградним шляхом. Це призводить до позитивних результатів лише у центральних різців і іклів.
Успішне пломбування кореня зуба досягається формуванням площині резекції з нахилом в сторону передодня. Кореневий канал розширюють тонкими фіссурним борами. Потім бором із зворотним конусом надають йому форму порожнини. Рану сушать марлевою серветкою, змоченою 10% розчином Гіперол, потім обробляють спиртом. Канал заповнюється амальгамою. Підвищена увага потрібно звернути на видалення зайвої амальгами. Що стосується оцінки втручання, то угорські автори (наприклад, Хорват) відзначають позитивні результати.
В процесі лікування зуба з гангренозної пульпою з наступним пломбуванням кореня можуть утворюватися гострі внутрішньоальвеолярні і внеальвеолярние абсцеси. У цих випадках, а також при поширених інфільтратах, що відносяться до третьої групи періоститу, потрібно чинити згідно методу, описаного в статті «Гострий гнійний періостит зубного походження».