Тканини-і органотропность у паразитів означає, що діапазон їх спадкової адаптованості обмежений не тільки певними органами і тканинами макроорганізму, а й певними типамиклітин цих тканин. Проникнення патогенного мікроорганізму в макроорганізм, але не в те середовище, до якої він адаптований, може не супроводжуватися розвитком типово протікає інфекційного процесу. Наприклад, підшкірне введення живого холерного вібріона людині не супроводжується розвитком типового для цього захворювання симптомокомплексу. Таким чином, тканинна диференціація організму господаря певною мірою виконує захисну функцію, обмежуючи зони існування та розмноженняпаразита в межах організму господаря.
На тканинної-органному рівні формуються основні риси патогенезу хвороби, позначаються потім на організменному рівні, визначаючи маніфестних проявів інфекційного процесу. Зрозуміло, подання про інфекційний процес не можна звести лише до локальних процесів, захоплюючим окремі групи клітин, - при цьому неминуче залучаються інтегративні системи організму. Навіть при так званих вогнищевих інфекціях, коли паразит локалізується в місцевому осередку і не поширюється по організму (наприклад, при фурункульозі стафілококи перебувають у волосяних фолікулах, при ангіні стрептококи мешкають в мигдалинах, при кон'юнктивітах локалізуються в кон'юнктиві ока тощо), порушення створюється таким чином рівноваги між мікро-і макроорганізму веде до генералізації інфекції. Проте навіть Політропний паразити, здатні до різної локалізації в організмі, викликають різні клінічні форми хвороби (наприклад, бубонна і легенева форми чуми, бубонна, очна, ангінозних або кишкова форми туляремії, різноманітні клінічні форми стрептококової інфекції та ін.)
Особливості патогенезу та клініки, Які проявляються на організмовому рівні ієрархії інфекційного процесу, позначаються потім на екосистемному рівні ієрархії епідемічного процесу, визначаючи характер та інтенсивність реалізації того чи іншого механізму передачі збудника. Так, посилення секреторної і рефлекторної діяльності дихальних шляхів при респіраторних інфекціях, що виражається в катаральних явищах у вигляді запалення слизових оболонок, рясного виділення секрету, судомного скорочення м'язів (кашель, чхання), сприяє реалізації повітряно-крапельного механізму передачі. Інтенсивне виділення заразного матеріалу з організму хворого при кишкових інфекціях (пронос і блювота) є необхідною фазою фекально-орального механізму передачі. При клінічно виражених формах трансмісивних інфекцій септицемія у хворого обумовлює лихоманку, комарі ж охочіше нападають на теплокровних, коли у останніх підвищена температура тіла.
Загальновідома епідеміологічна значимість і такого показника организменного рівня, як тривалість інкубаційного періоду при різних інфекційних хворобах: на екосистемному рівні інфекції, характеризуються коротким інкубаційним періодом, за інших рівних умов мають здатність до більш швидкого поширення і відтворення популяції паразита в порівнянні з інфекціями з тривалим інкубаційним періодом. Формирующаяся на організмовому рівні клінічна маніфестной кожного окремого випадку захворювання відбивається на екосистемному рівні і зростанням манифестной ураженості популяції біологічного господаря.
Інтенсивність взаємодії популяцій паразита і господаря на виході з екосистемного рівня формує ступінь манифестной ураженості населення і розмір дезорганизующего впливу хвороби на суспільство (місцеве населення, група, колектив) на рівні локальної та регіональної епідеміологічних соцекосістем. На виході з локальної та регіональної соцекосістем ці процеси змінюють локальні та регіональні показники соціально-економічної значущості даної хвороби.
У свою чергу процеси на рівні локальних і регіональних соцекосістем позначаються на рівні глобальної епідеміологічної соцекосістеми дезорганізують впливом на життя світового співтовариства (зростання показників соціально-економічної значущості даної хвороби в світі).
Таким чином, епідемічний процес як багаторівнева, організована ціла система характеризується різноманіттям складних і неоднозначних взаємозв'язків як на кожному рівні своєї системи, так і між цими рівнями.
Відображення цих принципів на всіх рівнях організованості епідемічного процесу наочно простежується на прикладі становлення епідемічного процесу «госпітального» сальмонельозу.
Останні десятиліття характеризуються ростом захворюваності населення багатьох країн світу на сальмонельоз. Зокрема, в СРСР за період з 1960 по 1990 р., тобто з часу введення офіційної реєстрації їх, захворюваність зросла більше ніж у 7 разів Однією з основних причин цього явища можна вважати виникнення і широке поширення лікарсько-стійких штамів сальмонел в Внаслідок масового і далеко не завжди виправданого застосування антибіотиків у медицині, тваринництві та інших областях.