Епідемічний процес, Як і інші живі системи, відноситься до організованих систем, що володіє наступними основними властивостями:
- Дані системи складаються з кінцевого числа компонентів (на відміну від неорганізованих систем, дечисло компонентів може бути нескінченним);
- Систему можна ділити на складові частини до тих пір, поки вона не розпадеться на «неподільні цілі» або «неподільні одиниці»;
- Поряд з властивостями, зумовленими складовими частинами, система володіє власними властивостями; вся система є щось більше, ніж сума її частин.

При цьому взаємодіючі системи та їх елементи постійно мінливі в результаті не тільки самого взаємодії, але і підвпливом мінливих умов проживання.

Саме складність епідеміологічних взаємозв'язків, Їх мінливість і очевидна непередбачуваність всіх можливих результатів впливів на епідемічний процес з боку людини зумовлюють необхідність впорядкування і логічної організації його вивчення за допомогою системної методології.

Популяційний рівень є першим над-організмовому. При аналізі явищ на цьому рівні окремо розглядаються процеси, що відбуваються як усередині популяції паразита, так і всередині популяції хазяїна, без урахування взаємодії цих популяцій і їх взаємної мінливості як результату цієї взаємодії.

Цілком очевидно, що внутріпопуляціонних процеси в певній мірі можуть цікавити епідеміолога, проте справжній інтерес для нього представляють не внутрішньо-, а міжпопуляційної (міжвидові) взаємодії, утворюють наступний над популяцій рівень-рівень паразитарної системи. Принципово невірним тому є твердження, ніби предметом епідеміології є популяційний рівень організації живого, оскільки насправді для епідеміології представляє інтерес саме паразитарна система, яка є біологічною основою епідемічного процесу.

Поняття « паразитарна система »Було введено в науку Е. Martini (1932 1936) для позначення взаємодії популяцій паразита та його господаря. З системних позицій у складі паразитарної системи нижчий рівень популяції паразита входить до складу вищого рівня популяції хазяїна, що є екологічним середовищем проживання популяції паразита. Зокрема, взаємодія популяцій паразита та хазяїна в межах паразитарної системи визначає внутріпопуляціонной мінливість цих популяцій.

Поняття « паразитарна система »- Суто біологічне, причому воно залишається таким і стосовно до того варіанту паразитарних систем, в якому господарем паразита є людина, оскільки для зручності вивчення в цьому випадку в аналіз залучається лише один, умовно виокремлювати, навмисно абстрагіруемий біологічний аспект єдиного та нерозривного соціально-біологічного поняття «людина» (наприклад, імунобіологічна структура населення). Поняття «паразитарний» означає «властивої паразитизму» і, природно, воно не може мати ніякої соціальної забарвлення (за винятком випадків, коли це поняття використовується в переносному сенсі для позначення життя за рахунок експлуатації чужої праці, дармоїдства, тобто у випадках, не мають ніякого відношення до даного нами предмету).

Ієрархічність будови епідемічного процесу полягає також і в тому, що паразитарна система включає в себе ієрархію безлічі інфекційних процесів.

Це стає очевидним, Якщо усвідомити собі, що паразитарна система дискретна, тобто по суті вона являє собою сукупність окремих особин популяції хазяїна, в організмі кожної з яких мешкають паразити і викликають інфекційний процес. Реалізація того чи іншого специфічного механізму передачі перетворює безліч індивідуальних інфекційних процесів (взаємодія на організмовому рівні) в паразитарну систему, тобто в міжпопуляційної (міжвидове) взаємодія. Таким чином, паразитарна система по суті являє собою спектр інфекційних станів в популяції хазяїна - від клінічно виражених захворювань до носійства. Саме тому екосистемний рівень включає в себе безліч інфекційних процесів.

Ієрархія інфекційного процесу також має багаторівневий характер: вона складається з систем супідрядних рівнів, при цьому кожен нижчий рівень входить до складу вищого в якості підсистеми. Перш за все ця ієрархія включає систему організмовому-го рівня (т. з. Власне інфекційний процес), безпосередньо входить до складу паразитарної системи. Наступними нижчестоящими рівнями є, як і в системі макроорганізму, тканинної-органний, клітинний і субклітинний (молекулярний) рівні (схема 4). Оскільки взаємодії всередині паразитарної системи відбуваються в межах і під впливом факторів середовища проживання цієї системи, то наступним, вищим рівнем є екосистемний. Цей рівень є взаємодія паразитарної системи з природним середовищем її існування. В екосистемі природна середу проживання є тим рівнем, до складу якого входить паразитарна система.