Для штамів триденної малярії помірного клімату характерні порівняльна доброякісність течії і швидке припинення нападів під дією протималярійних засобів. Розрізняють штами триденної малярії із тривалою інкубацією, коли захворювання настає через 8-14 місяців після зараження (тобто в наступному епідемічному сезоні) з наступними рецидивами протягом 2-3 місяців. Південні штами триденної малярії помірної зони, штами з короткою інкубацією, дають початкові прояви хвороби через 12-14 днів після зараження і ближні рецидиви, а також віддалені рецидиви через 7-12 місяців. Є штами, що дають прояви у одних хворих після тривалої, а в інших після короткої інкубації.

Ряд штамів триденної малярії тропічного клімату дають клінічні прояви тільки після короткої інкубації і відрізняються великим завзяттям рецидивування протягом найближчих 1-15 років. Триденна малярія, що викликається P. ovale, відрізняється, як правило, доброякісним перебігом.
Загальна тривалість інфекції при триденної малярії визначається в 15-2 рідко 3 роки.

Триденна малярія може ускладнитися малярійним гепатитом або нефритом. При важкому перебігу можуть розвинутися периферичні неврити. Зазначені ускладнення виникають тільки при відсутності своєчасного правильного лікування, звичайно тільки в ослаблених хворих. Найбільш злоякісним ускладненням триденної малярії є «блискавична» форма.

Чотириденна малярія. Зазвичай протікає доброякісно. Напади квартал можуть протікати без значного збільшення печінки та селезінки. Паразити нерідко виявляються в малій кількості і з великим трудом. Класична чотириденна малярійна лихоманка сама по собі є важливим діагностичним ознакою. Разом з тим лихоманка при квартане може бути щоденною (quartana triplex при наявності трьох генерації малярійних плазмодіїв) або за 2 днями гарячкових нападів може слідувати день апірексін (quartana duplex). З іншого боку, лихоманка чотириденного типу описана при деяких немалярійних захворюваннях, септичних станах, «термоневроз» та ін

Чотириденної малярії властиво м'яке протягом без ускладненні. Однак ряд авторів підкреслює частоту ниркових ураженні - нефрозу або нефрозо-нефриту. Нефротичний синдром - набряки, затримка сечі, протеїнурія, циліндрурія, гіперхолестерікемія - виникає частіше у дітей.

Напади чотириденної малярії легко припиняються під дією протималярійних засобів, однак повне лікування досягається важко. Описані рецидиви чотириденної малярії через 10-20 45 років і більше.

Прівівная чотириденна малярія. В літературі наводяться численні випадки і навіть спалаху квартал, що виникли при переливанні крові від донорів, що перехворіли цією формою малярії мною років тому, що пов'язано, мабуть, з наявністю у хворих чотириденної малярії тривалого розмноження ерітроцітарпих форм без клінічних проявів. Прівівная чотириденна малярія часто протікає атипово. Клінічні прояви у реципієнтів можуть виникнути в строки ох декількох тижнів до декількох місяців після переливання крові.