Мікроорганізми жорстко конкурують між собою. Це пов'язано з тим, що живуть в конкретному біоценозі мікроби мають принципово подібними потребами в джерелах енергії та харчування. Кожен мікроорганізм пристосовується не тільки до неживим субстратів, але і до інших оточуючих його організмам. Подібна адаптація іноді призводить до придбання особливих метаболічних властивостей, що наділяють володаря здатністю займати специфічні ніші. Наприклад, нитрифицирующие бактерії можуть рости без органічних джерел енергії, окислюючи аміак або нітрити в якості джерела енергії за відсутності світла, інші організми в подібних умовах не розвиваються. Тому нитрифицирующие бактерії не відчувають біологічної конкуренції. Значна частина бактерій бере участь у конкурентній боротьбі, адаптуючись до співіснування з іншими формами життя або вступаючи з ними в протидія.
Симбіоз
Симбіоз [от греч. symbiosis, совместное проживание]- Спільне тривале існування мікроорганізмів в довгоживучих спільнотах. Взаємовідносини, при яких мікроорганізм розташовується поза клітинами господаря (більшого організму), відомі як ектосімбіоз; При локалізації всередині клітин - як ендосимбіоз.
Типові ектосімбіотіческіе мікроби - Escherichia coli, бактерії пологів Bacteroides і Bifidobacterium, Proteus vulgaris, a також інші представники кишкової мікрофлори. Як приклад ендосимбіоз можна розглядати плазміди, що забезпечують, наприклад, резистентність бактерій до ЛЗ. Симбіотичні відносини також поділяють за вигоді, одержуваної кожним з партнерів.
Мутуалізмом [от лат. mutuus, взаимный]- Взаємовигідні симбіотичні відносини. Так, мікроорганізми виробляють БАБ, необхідні організму господаря (наприклад, вітаміни групи В). При цьому живуть у макроорганізму ендо-і ектосімбіонти захищені від несприятливих умов середовища (висихання і екстремальних температур) і мають постійний доступ до живильних речовин. З усіх видів мутуалізму найбільш дивно культивування деяких грибів комахами (жуками і термітами). З одного боку, це сприяє більш широкому поширенню грибів, з іншого - забезпечує постійне джерело поживних речовин для личинок. Це нагадує вирощування людиною корисних рослин і мікроорганізмів.
Коменсалізм - Різновид симбіозу, при якій користає тільки один партнер (не приносячи видимої шкоди іншому); мікроорганізми, що беруть участь в таких взаєминах. - Комменсали[от лат. сот-, с, + mensa, стол; буквально — сотрапезники]. Мікроорганізми-комменсали колонізують шкірні покриви і порожнини організму людини (наприклад, ШКТ), не заподіюючи «видимого» шкоди; їх сукупність - нормальна мікробна флора (природна мікрофлора). Типові ектосімбіотіческіе організми-комменсали - кишкова паличка, біфідобактерії, стафілококи, лактобацили. Багато бактерії-комменсали належать до умовно-патогенної мікрофлори і здатні за певних обставин викликати захворювання макроорганізму (наприклад, при внесенні їх в кровотік під час медичних маніпуляцій).