Дуже рано в процесі розвитку людини та інших ссавців з'являється так звана клоакальная мембрана, яка вже багато разів згадувалася в попередніх статтях, присвячених бластогенез. Клоакальная мембрана - це місце, в якому ектодерма хвостового зародкового щитка - донизу від первинної смужки - з'єднується з ентодермою без посередництва мезодерми. З цієї області в зародковий шар відходить закладка аллантоиса.

Трохи пізніше область клоакальной мембрани при відокремленні хвостового кінця зародка потрапляє на вентральній сторону ембріонального тіла. Задня кишка в цій галузі утворює веретеноподібне мешковіднео розширення, зване клоакою, а клоакальная мембрана являє собою його вентральній кордон.

Наприкінці першого місяця розвитку з краниального кінця клоаки відходить конусоподібний відросток - сечовий шлях зародка (urachus), який у вигляді аллантоісной протоки (ductus allantoideus) триває в зародковий стовбур (пізніше - в пуповину).

У каудальному напрямку клоака потім продовжується в хвостову кишку, яка закінчується сліпо і дуже скоро, разом з хвостовим відростком тіла, піддається зворотному розвитку. У краніальному напрямку клоакальная порожнину повідомляється з кишковою трубкою. На обох сторонах латеральних клоаки в неї відкриваються вольфови вивідні канали.

Клоака є дефінітивного органом нижчих хребетних, у яких вона служить місцем скупчення продуктів отпада, що надходять з кишки, з сечового апарату; в неї також відкриваються і вивідні шляхи репродуктивних органів. У вищих хребетних і у людини порожнину клоаки ділиться на ректальну (ректальну) частину і на частину урогенітальну (сечостатеву), які самостійно відкриваються на поверхні тіла і які відокремлюються одна від одної промежиною (perineum).

У просторі між аллантоісной протокою і місцем повідомлення задньої кишки з клоакальной порожниною знаходиться скупчення мезенхіми. З цього скупчення в каудальному напрямку починає висуватися мезенхімних, в основному фронтально розташована перегородка, яка розділяє клоакальной порожнину на передню і задню частини.

Ця перегородка носить назву сечо-прямокишково перегородки (septum urorectale). Вона проростає аж до клоакальной мембрани, відокремлюючи потім повністю дорсальную частина клоаки від вентральної. Дорсальна частина клоаки є закладкою прямої кишки. Вентральна частина в результаті звуження ділиться на більш краніальний відділ, на так звану везікоуретральную закладку, з якої виникають сечовий міхур і примикає частина сечоводу.

В цей відділ через сечовий шлях зародка відкривається аллантоісной проток, обидва вольфова каналу, а пізніше сюди переміщуються і отвори сечоводів і обох Мюллерова каналів, про розвиток та значення яких буде сказано в наступній главі, висвітлює розвиток статевих органів. Більш каудальний відділ вентральної частини клоакальной порожнини називається сечостатевої пазухою (sinus urogenitalis), оскільки він є закладкою для розвитку сечовипускального каналу і деяких частин статевих органів.