Екологічні дослідження можна розділити на вивчення або безлічі організмів, що населяють цю територію (екологія спільнот, або синекологія), або конкретного виду (аут-екологія). В обох випадках необхідно насамперед ознайомитися з уже накопиченими за обраною темою даними і обговорити їх, а потім чітко визначити цілі, природу і рамки роботи. Будь-яке дослідження направлено на вирішення неясних питань і (або) перевірку гіпотез.

Робота повинна ставити перед собою як загальні, так і приватні (специфічні) цілі. Наприклад:
1) задоволення наукової цікавості;
2) розвиток здатності планувати дослідження, формулювати гіпотези і розробляти експериментальні методики;
3) розвиток здатності визначати невирішені питання і методи збору якісних і кількісних даних для їх вирішення;
4) розвиток навичок використання технічних засобів, включаючи апаратуру і таблиці для ідентифікації організмів;
5) пошук оптимального способу реєстрації даних;

6) розвиток здатності застосовувати накопичені знання для інтерпретації нових даних;
7) розвиток критичного погляду на зібрані раніше дані, перевірка їх достовірності і логічності зроблених на їх основі висновків;
8) розвиток здатності обмінюватися біологічної інформацією за допомогою таблиць, графіків, записів і т. п.;
9) розвиток у суспільстві дбайливого ставлення до природи та розуміння важливості її охорони;
10) поглиблення знань про відносини організмів між собою і середовищем їхнього життя, а також динамічних питань екології цієї спільноти. Цей перелік можна продовжити, включивши в нього ще безліч специфічних завдань.

Звіт про екологічний дослідженні

Незалежно від того, наскільки вдало дослідження і цінні зібрані дані, Результати не принесуть особливої користі іншим дослідникам, якщо не будуть представлені у вигляді звіту, який повинен виглядати наступним чином.

1. Вступ: включає обгрунтування вибору теми, проблеми, гіпотези і мети (що і навіщо ви хотіли зробити).
2. Метод: опис того, що ви робили, коли, де і яким способом, включаючи практично важливі відомості про технічні засоби та хід роботи в польових і лабораторних умовах.
3. Результати і спостереження: конкретні цифри і дані, включаючи таблиці, графіки, схеми та інші форми стислого і точного уявлення накопиченого наукового матеріалу.
4. Обговорення результатів: аналіз отриманих даних (по можливості кількісний) на тлі того, що вже було відомо раніше, і спроба зробити з цього певні висновки.
5. Обговорення правомірності висновків: критична оцінка використаних методів та джерел можливих помилок, а також пропозиції, що стосуються подальших досліджень даної проблеми.
6. Список використаних публікацій.