Основним джерелом африканського трипаносомозу є людина. Питання щодо ролі природних резервуарів сонної хвороби, спричиненої Т. garnbiense, ще повністю не з'ясований: він ускладнюєтьсятим, що в ендемічних зонах дикі ссавці можуть бути носіями різних видів трипаносом - збудників трипаносомоз він тварин (Т. brucei і Др.), морфологічно не відрізняються від Т. gainbiertse і Т. rhodesiense. Певну роль в епідеміології африканського трипаносомозу можуть грати свині. Зокрема, висока зараженість свиней Т. ganibiense встановлена в Нігерії. Що стосується Т. rhodesiense, то роль антилоп Trageiaphus scriptns як резервуара цієї інфекції доведена.
Хворий трипаносомозов є джерелом інфекції протягом усього періоду захворювання, проте рівень паразитемии в II стадії хвороби нижче, ніж в I стадії. Безсимптомні паразітоносітеля складають приблизно 10% від числа виявлених хворих, паразитоносійство буває тривалим (до 20 ліг і більше). Такі «приховані» джерела інфекції відіграють велику роль у поширенні хвороби.
Ефективне зараження мух Glossina відбувається при температурі від 24 до 37. В організмі мухи відбувається цикл розвитку трипаносом, який триває в середньому 18-25 диен. Потрапивши з кров'ю в середню кишку мухи, трипаносоми спочатку розвиваються в просвіті перітрофіческой мембрани. потім проникають через підставу перітрофіческой мембрани в преджелудок. Далі трипаносоми піднімаються по стравоходу до глотки, проникають у слинні залози, в гнпофарінкс, в хоботок. У слинних залозах трипаносоми приймають форму крітідіі. Крітідін розмножуються і знову припадаю? форму трипаносом (метацнкліческіе трипаносоми), які при укусі мухи потрапляють із слиною в кров людини або тварини і заражає його. Мухи залишаються заразними протягом 2-3 місяців. Кількість трипаносом, що виділяються мухою при кровосмоктанні, збільшується в другій половині її життя. Інфікуються доза для людини становить приблизно 300-450 трипаносом.
Зараження може відбуватися також голкою від шприца після маніпуляцій з хворими або носіями, мають трипаносом в крові, пли при переливанні крові від таких осіб. Безпосередньо від хворого здоровому трипаносоми можуть бути механічно занесені комахами (мухи, гедзі, комарі, клопи та ін), на хоботку яких трипаносоми зберігають життєздатність протягом кількох годин. Може мати місце також зараження плоду від хворої матері через плаценту.
Профілактика і заходи боротьби. Заходи, спрямовані на профілактику, боротьбу та ліквідацію африканського трипаносомозу, повинні включати виявлення, ізоляцію і лікування хворих, масову та індивідуальну хіміо-профілактику населення, знищення переносників.
Обстеження населення з метою виявлення хворих повинні бути плановими і ретельно проводитися в строго встановлені терміни (не рідше 2 разів на рік) з тим, щоб виявити хворих в початковій стадії захворювання. У вогнищах африканського трипаносомозу з високим рівнем захворюваності важливо обстежити все населення. Методи діагностики, які використовуються в даний час, ще недостатньо ефективні для виявлення ранньої фази інфекції, у зв'язку з чим необхідні повторні обстеження населення у вогнищах з інтервалами 3-6 місяців.
З метою попередження поширення інфекції виявлених хворих необхідно на період лікування ізолювати в спеціалізовані лікувальні установи, віддалені від місць проживання мух цеце.
Для хіміопрофілактики африканського трипаносомозу застосовують пентамідин (ломідін). Одноразова ін'єкція препарату з розрахунку 0.004 г /кг у вигляді 4% розчину внутрішньом'язово попереджає захворювання протягом 6 місяців, тому хіміопрофілактику необхідно періодично повторювати.