Поперечно м'язи називаються також скелетної мускулатурою оскільки вони прикріплюються до складових частин скелета. Скелетні м'язи починають диференціюватися з миотомов приблизно на п'ятому тижні розвитку. Їх окремі пучечки об'єднуються в більші м'язові сукупності, які характеризуються особливим місцем розташування на що розвиваються закладках кісток.

Дані скелетної мускулатури спочатку розташовуються метамеріческі відповідно до першими сегментами. У зв'язку з цим первинні м'язові одиниці позначаються як міомери. На закладку аксіального (осьового) скелета, тобто закладки хребців, міомери насідають після поділу склеротомов і після їх вторинного об'єднання в тіло хребця, при цьому вони, насідаючи як би "верхом", з'єднують два сусідніх хребця.

Окремі міомери відокремлюються один від одного за допомогою простих фронтальних перегородок, що складаються з мезенхіми, так званих міосепти. Таке примітивне розподіл мускулатури в дорсальній і вентральній областях тіла в принципі зберігається в нижчих хребетних і у ланцетника, у той час як у людини і у вищих хребетних воно в процесі філогенетичного розвитку піддається значним змінам у розподілі та розташуванні окремих м'язових елементів і їх сукупностей.

У дорсальній області окремі міомери зливаються в більші багатосегментні м'язові комплекси, а сегментація, за винятком деяких м'язів (міжхребцевих м'язів ) в області хребта, поступово стирається, перестаючи бути явно видимою. Зберігається лише первісна сегментна іннервація окремих м'язових сукупностей, яка часто є єдиним ознакою аутохтонно дорсального походження цих м'язів і їх первісної сегментації. З більш поверхневого (епаксіального) шару дорсальних м'язів розвиваються довгі м'язи спини і шиї, в яких уже не виявляється сегментація.

Вентральні подовження первинних миотомов дає початок виникненню мускулатури грудної клітини та черевної стінки. Тут, як і в дорсальній області, спочатку зливаються окремі сегментні закладки в більші комплекси, причому сегментована структура зберігається тільки у міжреберних м'язів. промежинні м'язи розвиваються пізніше, а саме з третього і четвертого крижового миотомов, з їх вентральних відділів.

Мускулатура кінцівок у людини і у вищих хребетних не виникає безпосередньо з миотомов, як це спостерігається у нижчих хребетних (наприклад у риб), у яких міотоми прямо подовжуються в закладки плавців у вигляді пупиришків. У людини, ймовірно, в мезенхимниє закладки проксимальної і дистальної кінцівок з області відповідних миотомов, розташованих в цих відділах, мігрують лише сукупності миобластов.

В освіті мускулатури кінцівок, таким чином, беруть участь і вихідні мезенхимниє компоненти самих закладок кінцівок. М'язи проксимальної кінцівки починають утворюватися швидше, ніж м'язи дистальної кінцівки (приблизно на початку другого місяця).

Мускулатура голови і шиї розвивається з області мезенхіми, яка в цьому місці, мабуть, відповідає сегментованим миотомов, проте це питання до цих пір залишається спірним (наприклад окорухових м'язи). Більшість м'язів області голови та шиї бере початок з мезенхіми зябрових дуг і зберігає свій зв'язок з їх хрящовими закладками і свою первісну іннервацію, хоча процес утворення цих м'язів не настільки очевидний і зрозумілий, як у нижчих хребетних.