Роздільною здатністю називають здатність приладу відобразити роздільно два дрібних максимально близько розташованих об'єкта. Нижче межі дозволу ці об'єкти будуть сприйматися як один об'єкт.

Роздільна здатність і збільшення електронного мікроскопа - Це не одне і те ж. Як би ми не збільшували фотографію, ми ніколи не зможемо розгледіти на ній окремі атоми. Зростає збільшення, але дозвіл залишається на фотографії колишнім.

Ми збільшуємо фотографію електронного мікроскопа, Щоб краще бачити зображення, але якщо продовжувати її збільшувати, то в кінці кінців зображення розпадеться на ряд окремих розпливчастих плям. Зрозуміти, в чому полягає відмінність між збільшенням і роздільною здатністю, можна також, порівнявши зображення клітини, отримані в світловому і в електронному мікроскопі при одному і тому ж збільшенні.

На малюнку добре видно, що два ці зображення дуже сильно розрізняються за своєю деталізованості. В електронному мікроскопі дозвіл набагато більше, оскільки у електронів довжина хвилі набагато менше, ніж у видимого світла.

Межа дозволу в електронному мікроскопі складає на практиці близько 05 нм, тоді як для світлового мікроскопа він дорівнює 200 нм. Це не означає, що електронний мікроскоп краще. Два ці мікроскопа призначені для різних цілей. Світловий мікроскоп, як і раніше незамінний як прилад, що дозволяє скласти загальне уявлення про клітинах і тканинах. До того ж і підготувати для нього матеріал можна набагато швидше і простіше. Він також дозволяє спостерігати живі об'єкти, що абсолютно неможливо зробити за допомогою електронного мікроскопа.