Безперервно поглиблюється порожнину ямки інвагінації відповідає порожнини первинного кишечника (архентерона) ланцетника. Її поглиблення обумовлюється вельми характерним переміщенням презумптівного матеріалу в дорсальній (передній) і в латеральних (бічних) губах бластопора.
Клітини в цих відділах починають швидко розмножуватися і так само, як у ланцетника, іммігрують всередину ямки (архентерона), тобто, як прийнято говорити, відбувається наростання губ бластопора. Різниця, але водночас і спільність пересувань цього матеріалу з гаструляціей ланцетника показані на наведених малюнках.
Точно так само, як і у ланцетника, Хордомезодермальний матеріал наростає на передній губі і через край бластопора переміщається всередину, розташовуючись по середній лінії спини під ектодермальну смужкою майбутньої медулярної пластинки. Хід хордальной закладки і медулярної пластинки визначає, таким чином, поздовжню вісь подовжуючого зародка.
Плечі ямки інвагінації, Яка спочатку має підковоподібний вид, є латеральні губи бластопора; через них відбувається наростання презумптівного матеріалу для мезодерми, який проникає під поверхневу ектодерми і переміщується у напрямку до черепно кінця ембріона. При цьому він розташовується з боків хордальной закладки, а краниально з'єднується з головним мезодермою, що бере початок з області передньої губи.
Таким чином як у ланцетника, Так і в амфібій, утворюється спинна сторона тіла зародка. (Порівняй з попередньою главою про гаструляції і нотогенезе ланцетника).
Нарешті, мезодермальні матеріал наростає і переміщується і через край задньої губи, тим самим обмежуючи її і замикаючи до сих пір ще відкриту задню кордон бластопора. Ця мезодерма переміщається в хвостовому напрямку, проникаючи під ентодерми і, врешті-решт, з'єднуючись з рештою (парахордальной) мезодермою в єдиний середній зародковий листок.
Разом з нею через отвір бластопора повільно переміщається і громіздка маса вегетативних клітин, яка спочатку виступала з округлого бластопора у вигляді так званої желточной пробки Русконі.
Поряд з цією недосконалою інвагінації, В процесі гаструляції спостерігається ще й нове явище, також обумовлене підвищеною кількістю желточного речовини в вегетативних макромерах.
Пігментована область бластодерми, Відповідна клітинам анимального полюса, з яких пізніше розвивається ектодерма, починає в результаті активного зростання переміщатися у напрямку до країв бластопора, тобто у напрямку до вегетативного полюса; таким чином, значна частина майбутніх ентодермальних клітин, що містять велику кількість жовтка, потрапляє всередину зародка завдяки тому, що відбувається їх обростання ектодерми. Цей супутній процес розвитку називається епіболії; на більш пізніх стадіях філогенетичного розвитку епіболіческое обростання поверхневої ектодерми починає превалювати над процесом інвагінації.
При цих процесах в Внаслідок освіти і розширення порожнини первинного кишечника маса вегетативних клітин, що створює закладку майбутньої ентодерми, повертається на 180 градусів і утворює дно і бічні стінки архентерона. Подібним чином, як і у ланцетника, у земноводних пізніше з цієї ентодерми формується примітивний, первинний, кишечник.
Дорсальна дах кишкової закладки спочатку не замкнута, і в цьому місці в його ентодерми проникає матеріал хорди і парахордальной мезодерми.
Відповідно до розвитком порожнини первинного кишечника, з поглибленням ямки інвагінації і з обростанням губ бластопора презумптівним матеріалом у всередину поступово зникає і порожнину бластоцель.