Головна » Імунологія » Електронний парамагнітний резонанс імуноглобулінів. Структура IgG (імуноглобуліну G)


Спектр електронного парамагнітного резонансу (ЕПР спінових міток) являє собою триплет. Співвідношення ширини цих трьох ліній визначається усередненням анізотропії g-фактора і надтонкої взаємодії спинов ядра азоту та неспареного електрона N-О-групи мітки в результаті її обертання. У деяких випадках спектр ЕПР є суперпозицією двох спектрів, що відповідають двом станам мітки з різною рухливістю.

Існують способи, Що дозволяють по співвідношенню ширини цих трьох ліній, на їхню положенню на осі напруженості магнітного поля і за їх залежно від потужності мікрохвильового випромінювання розраховувати часи кореляції міток в межах від 10-11 сек до 10 ~ 3 сек. Час кореляції характеризує швидкість обертання N-О-групи мітки і якісно може бути представлено як величина, зворотна частоті обертання мітки. У тих випадках, коли мітка пов'язана з білком не жорстко, зміна її часу кореляції може відображати зміна конформації білка в області її приєднання.

Коли мітка зв'язується з білком жорстко, тобто її N-О-групи не має власної волі обертання щодо білка, яке визначається по спектру ЕПР час кореляції, так само часу кореляції макромолекули. Відповідно до закону Стоку - Ейнштейна.

У тих випадках, коли N-О-група мітки, Ковалентно пов'язаної з білком, зберігає свободу обертання, її спектр електронного парамагнітного резонансу визначається інтенсивністю броунівського руху мітки щодо макромолекули і швидкістю обертальної дифузії самої молекули. Тому визначається за спектром електронного парамагнітного резонансу зміна часу кореляція N-О-групи може бути викликано зміною не тільки мікрооточення мітки, але й ефективного радіусу Стокса макромолекули.

Для випадку, коли рух N-О-групи мітки щодо макромолекули близько до ізотропному, нами був запропонований метод, що дозволяє одночасно отримувати інформацію не тільки про зміну мікрооточення спінової мітки, а й про структурних перебудовах в міченої макромолекулі, що призводять до зміни її часу кореляції.

Існують прийоми, що дозволяють визначати відстані між нітроксільним радикалом і парамагнітним іоном хметалла або між двома іміноксільнимі радикалами. Вони засновані або на залежності розщеплення і додаткового розширення ліній від відстані між парамагнітними центрами, що виникають при впливі магнітних диполів, або на залежності амплітуди результуючого спектра електронного парамагнітного резонансу від величини потужності надвисокої частоти (крива насичення).
Описувані в статтях результати в значній мірі базуються на недавно проведених рентгеноструктурних аналізах з високим ступенем дозволу.

Всі вивчені домени мають дуже схожу тривимірну структуру. Як можна було очікувати з даних по первинній структурі, гомологічні варіабельні домени або постійні домени більше схожі один на одного, ніж варіабельні домени на постійні.

Основною структурної характеристикою домену є антипаралельних шар бета-складчастості, який складається з витягнутих сегментів поліпептидних ланцюгів, пов'язаних вигнутими частинами (коліна) ланцюга. Два таких шару подібно сандвіч прилягають один до одного з антипаралельних напрямком сегментів ланцюга. Прилеглі сегменти пов'язані водневими зв'язками. Один з шарів складається з трьох сегментів, а інший з чотирьох. Така двошарова структура особливо чітко помітна у постійного домена, де вона носить більш закономірний характер. У вариабельного домену відзначається додаткова петля, знаходився інший гіперваріабельну область.



...


1 (0,00439)